El Programa Naturopático con Estructura Modular (PNEM) tiene la siguiente estructuración
Son programas con una estructura formativa abierta y progresiva:
Abierta: es el alumnado el que selecciona el itinerario a seguir según sus intereses formativos dentro de un marco programado desde la dirección docente.
Progresiva: Sistema progresivo que permite ir sumando créditos para ir accediendo a titulaciones de nivel superior.